Οι λειτουργίες καθρέφτη περιλαμβάνουν την ηλεκτρική ρύθμιση καθρέπτη, τη θέρμανση καθρέπτη, τη μνήμη του καθρέφτη (προαιρετικός εξοπλισμός) και την ηλεκτρική dαναδίπλωση του καθρέφτη (προαιρετικός εξοπλισμός).
Η ηλεκτρική μετακίνηση των καθρεφτών επιτυγχάνεται μέσω των δομοστοιχείων περιφερειακών συστημάτων από την πόρτα οδηγού και την πόρτα συνοδηγού. Οι ρυθμιστικοί διακόπτες βρίσκονται στο κεντρικό μπλοκ διακοπτών της πόρτας οδηγού.
Η ενεργοποίηση του διακόπτη μεταδίδεται μέσω του δίαυλου P από το μπλοκ διακοπτών στο δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων στην πόρτα. Το δομοστοιχείο πόρτας ενεργοποιεί μέσω γεφυρών ημιαγωγών τα ρυθμιστικά μοτέρ στους καθρέφτες.
Για την οριζόντια και την κάθετη μετακίνηση είναι τοποθετημένος από ένα ηλεκτρικό μοτέρ στο περίβλημα του καθρέφτη.
Αν έχει τοποθετηθεί στο όχημα μία μνήμη θέσεων ρύθμισης καθίσματος/τιμονιού, τότε επίσης καταγράφονται και αποθηκεύονται οι θέσεις του καθρέφτη.
Η μνήμη θέσεων ρύθμισης καθίσματος/τιμονιού έχει ένα ξεχωριστό δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων (ατομικό πρόγραμμα διάγνωσης), το οποίο είναι συνδεδεμένο μέσω του δίαυλου P με την κεντρική μονάδα ελέγχου του κεντρικού ηλεκτρονικού συστήματος αμαξώματος. Οι θέσεις για το κάθισμα και την κολόνα τιμονιού καταγράφονται και αποθηκεύονται σε αυτό το δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων.
Παράλληλα αποθηκεύονται και οι θέσεις των καθρεφτών στα δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων των θυρών (δομοστοιχεία πόρτας).
Η καταγραφή των θέσεων καθρέφτη επιτυγχάνεται μέσω των ποτενσιόμετρων, που είναι τοποθετημένα στο μηχανισμό κίνησης του καθρέφτη.
Ο χειρισμός της λειτουργίας της μνήμης επιτυγχάνεται μέσω του διακόπτη μνήμης, ο οποίος είναι συνδεδεμένος μέσω τεσσάρων αγωγών με το δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων της πόρτας οδηγού. Οι πιέσεις των πλήκτρων μεταδίδονται μέσω του δίαυλου P στην κεντρική μονάδα ελέγχου.
Η αποθήκευση των θέσεων καθρέπτη, καθίσματος και κολώνας τιμονιού επιτυγχάνεται από τον ακροδέκτη R. Μετά το πάτημα του κόκκινου πλήκτρου μνήμης ανάβει αυτό για το πολύ 7 δευτερόλεπτα. Αν σε αυτό το χρονικό διάστημα πατηθεί ένα από τα πλήκτρα αποθήκευσης (1, 2 ή 3), τότε αποθηκεύονται οι επίκαιρες θέσεις στην επιλεγμένη θέση μνήμης αποθήκευσης.
Η κλήση μίας αποθηκευμένης θέσης είναι δυνατή σε κάθε χρονική στιγμή. 16 λεπτά μετην απενεργοποίηση της ανάφλεξης πραγματοποιείται όμως μία απενεργοποίηση της λειτουργίας, μέχρι να ενεργοποιηθεί πάλι ο ακροδέκτης R ή να λάβει χώρα μία αλλαγή σήματος σε μία είσοδο του δομοστοιχείου (π.χ.: άνοιγμα μίας πόρτας)
Η κλήση των θέσεων πραγματοποιείται, με το να πατιέται το επιθυμητό πλήκτρο αποθήκευσης (1, 2, ή 3) για τόσο χρονικό διάστημα, μέχρι να εκτελεστούν όλες οι ρυθμίσεις. Επιπλέον είναι δυνατό να ξεκινήσει μία αυτόματη διαδικασία, όταν πατηθεί για λίγο το πλήκτρο. Αυτή η ”λειτουργία μπουτόν επαφής” είναι δυνατή, όταν:
Η θέρμανση καθρέπτη ρυθμίζεται από τα δομοστοιχεία περιφερειακών συστημάτων στις πόρτες. Η θέρμανση είναι ενεργή από τον ακροδέκτη 15 (θέση διακόπτη ανάφλεξης 2). Ο χρόνος ενεργοποίησης εξαρτάται από την εξωτερική θερμοκρασία.
Η κεντρική μονάδα ελέγχου λαμβάνει από τα ηλεκτρονικά ταμπλώ οργάνων μέσω του δίαυλου Κ τη εξωτερική θερμοκρασία και υπολογίζει ένα χρονικό διάστημα για τη θέρμανση. Αυτός ο χρόνος μεταδίδεται στα δομοστοιχεία και εκτελείται εκεί. Όταν η εξωτερική θερμοκρασία είναι μεγαλύτερη από 25oC δεν πραγματοποιείται καμία θέρμανση πια, όταν είναι μικρότερη από -10oC τότε είναι ενεργοποιημένη διαρκώς η θέρμανση.
Με τον ηλεκτρικό μηχανισμό κίνησης για την αναδίπλωση των εξωτερικών καθρεπτών (προαιρετικός εξοπλισμός) μπορούν να διπλωθούν οι δύο εξωτερικοί καθρέπτες ενάντια στην κατεύθυνση κίνησης του οχήματος.
Το πλήκτρο επαφής για την αναδίπλωση βρίσκεται στο μπλοκ διακοπτών της πόρτας οδηγού. Το σήμα του πλήκτρου επαφής μεταδίδεται μέσω του δίαυλου P στα δομοστοιχεία περιφερειακών συστημάτων στις πόρτες. Ανάλογα με τη θέση των καθρεπτών διπλώνονται αυτοί έπειτα προς τα μέσα και προς τα έξω.
Εκτός από τις εξωτερικές διαφορές σχεδιασμού οι καθρέπτες για τα οχήματα σειράς των μοντέλων E38/E39 διαφέρουν από τους καθρέπτες για το μοντέλο E39 M5 (αγωνιστικός σπορ σχεδιασμός).
Στους καθρέπτες των οχημάτων της σειράς έχει τοποθετηθεί ένας μικροδιακόπτης, ο οποίος ενεργοποιεί ένα σήμα γείωσης στο αντίστοιχο δομοστοιχείο περιφερειακών συστημάτων, όταν ένα καθρέπτης διπλωθεί προς τα μέσα ή προς τα έξω με το χέρι ή μετά από ένα χτύπημα. Ο μικροδιακόπτης είναι απαραίτητος, επειδή με αυτό το δίπλωμα προς τα μέσα ή προς τα έξω λαμβάνει χώρα μία αποσύζευξη μεταξύ του μηχανικού συστήματος καθρέπτη και του μοτέρ διπλώματος. Αν ένας καθρέπτης, ο οποίος είναι αποσυζευγμένος μηχανικά, ενεργοποιηθεί πιέζοντας το πλήκτρο επαφής, τότε το μοτέρ αναδίπλωσης μετακινεί τον καθρέπτη προς τη διεύθυνση αναδίπλωσης, μέχρι να σηματοδοτήσει ο μικροδιακόπτης το κούμπωμα. Ο μέγιστος χρόνος ενεργοποίησης του μοτέρ ανέρχεται το πολύ σε 15 δευτερόλεπτα
Λόγω του τροποποιημένου μηχανικού συστήματος δεν είναι πια απαραίτητος αυτός ο μικροδιακόπτης στον καθρέπτη για το E39 M5.
Επειδή τα μοτέρ αναδίπλωσης των καθρεπτών λειτουργούν σαν σώμα, είναι δυνατή μία θερμική υπερφόρτωση όταν ο χειρισμός πραγματοποιείται πολύ συχνά. Για να αποτραπεί αυτό, έχει προβλεφτεί μία ασφάλιση επανάληψης, η οποία ασφαλίζει τα μοτέρ αναδίπλωσης για 3 λεπτά μετά από 6 χειρισμούς μέσα σε 1 λεπτό.