ท่อร่วมไอเสียได้รับการกำหนดให้เป็นไปตามข้อบังคับทางกฎหมายว่าด้วยการปล่อยมลพิษ เครื่องยนต์ S54 เป็นไปตามกฎข้อบังคับเกี่ยวกับไอเสีย EU4 (ใช้สำหรับประเทศยุโรป) และ LEV1 และ LEV2 (ใช้สำหรับรุ่น US) ด้วยระบบไอเสียที่ติดตั้งอยู่ ในระหว่างการเผาไหม้น้ำมันเชื้อเพลิง ออกซิเจนในอากาศจะทำให้เกิดน้ำและคาร์บอนไดออกไซด์ ขณะที่การเผาไหม้ยังไม่สมบูรณ์ดี จะเกิดผลผลิตอื่นจากการเผาไหม้ขึ้น ส่วนประกอบเหล่านี้ของมลพิษในไอเสียมีสัดส่วนเท่ากับ 1 % ในเครื่องยนต์เบนซิน ส่วนใหญ่ที่เกิดขึ้น ได้แก่ คาร์บอนมอนอกไซด์, ไฮโดรเจนคลอไรด์ และไนโตรเจนออกไซด์ เครื่องฟอกไอเสียจะช่วยเปลี่ยนสารมลพิษเหล่านี้ให้เป็นน้ำและคาร์บอนไดออกไซด์
ในเครื่องฟอกไอเสียของเครื่องยนต์ S54 จะใช้โมโนลิธแบบโลหะ ซึ่งมีช่องหลายพันช่องที่แก๊สไอเสียไหลผ่าน ข้อดีของโมโนลิธประเภทนี้ เมื่อเปรียบเทียบกับโมโนลิธแบบเซรามิก (เครื่องฟอกไอเสียแบบเซรามิก) คือ ความดันย้อนกลับของแก๊สไอเสียจะต่ำกว่า และระยะทำความร้อนจะสั้นกว่า
ปฏิกิริยาทางเคมีที่มีสารเจือปน เช่น มีปริมาณของสารตะกั่วในน้ำมันเชื้อเพลิงมากเกินไป อาจทำให้ชั้นผิวของเครื่องฟอกไอเสียเสียหายได้ (การเกิดพิษทางเคมี) การเกิดพิษทางเคมียังเกิดขึ้นในกรณีที่มีน้ำมันเครื่องในมลพิษเป็นปริมาณสูงมากด้วย ชั้นผิวของเครื่องฟอกไอเสียที่มีการใช้งานอาจถูกเคลือบด้วยสารตะกั่วและซัลเฟอร์จากน้ำมันเชื้อเพลิงและน้ำมันเครื่องด้วยเช่นกัน (การเกิดพิษแบบกลไก) นอกจากนี้ ยังเป็นไปได้ที่จะเกิดการเสื่อมอายุจากความร้อนด้วย จำนวนที่เพิ่มขึ้นของการจุดระเบิดผิดพลาดในการเผาไหม้ ซึ่งเกิดขึ้นเป็นระยะๆ อาจเป็นการบ่งบอกถึงเครื่องฟอกไอเสียที่ได้รับความเสียหายจากความร้อนได้